在MySQL数据库中存储一万行数据与将一万个JSON文件存储在文件系统中（或一份包含一万个JSON对象的JSON文件）之间存在一些重要的差异，包括数据体积和查询速度：


1. **数据体积**：

   - **MySQL数据库**：数据库通常需要额外的存储空间来维护表结构、索引和元数据。这可能导致存储一万行数据占用的总体积比JSON文件大一些。

   - **JSON文件**：JSON文件通常更紧凑，不需要额外的结构元数据。因此，存储一万个JSON对象可能会占用相对较少的存储空间。


2. **查询速度**：

   - **MySQL数据库**：数据库管理系统通过索引、查询优化和并发处理来加速数据检索。因此，对于需要复杂查询、过滤和排序的操作，数据库通常会更快。

   - **JSON文件**：对于JSON文件，您需要手动解析JSON数据，这可能会导致较慢的查询速度，特别是在大型JSON文件中查找数据时。


总之，如果您需要频繁进行复杂的查询、排序、过滤和连接操作，MySQL数据库通常会更快。此外，数据库还提供了事务支持和数据完整性保障。但如果数据量不大，且查询需求相对简单，或者只是用于数据交换目的，JSON文件可能更为简单和有效。


综合考虑，您可以根据具体需求来选择数据库或JSON文件。有时，将数据存储在数据库中，同时使用JSON文件进行数据交换也是一种有效的策略。